被各国分割统治的中世纪的神州·日本。在那上空中由八艘船组成的都市舰“武藏”航行着……在遥远的未来。经过了“重奏统合争乱”，并把联繫着人类的命运的“圣谱”作为原本历史的再现而执行的各国。然后，是各式各样把迷惑与决意藏于胸口，前进开拓着未来的人们。把互相重合的中世纪世界作为舞台，学生们在学园国家间的抗争正式上演了！

他有一身出类拔萃的功夫，但在现实世界中却没有用武之地，只能做个见不得光的杀手。 而去到了混乱不堪的异界，在你死我活的战场上他的实力却得到最大程度的发挥。 在这里，他可以肆无忌惮地挥舞手中的武器；在这里，为了生存，他别无选择走上那条属于他

1889年，世界正处于工业革命蓬勃发展的时代，国与国之间交往密切，距离一下子被拉近。然而贪婪仍是主流，欧洲列强在亚非地区展开掠夺，战争的阴影始终笼罩在世界的上空。当年在法国巴黎举行的万国博览会上，酷爱发明的14少年让（日高のり子 音）结识了来自马戏团的女孩娜蒂娅（鷹森淑乃 音）。黑色的头发、褐色的皮肤以及周身散发的神秘气质另让倍感好奇，而他很快便和娜蒂娅卷入一场纷争之中。钟爱宝石的格兰蒂斯及其两个手下汤姆和汉森对娜蒂娅胸前佩戴的蓝宝石展开围追堵截，他们此时还不知道，这块宝石隐藏着惊人的秘密。在接下来的日子里，让和娜蒂娅围绕这颗宝石展开了一连串的大冒险……

十年前，东京出现了一个不能解释的领域。从那片领域走出的人获得了一种特殊的超能力——可以随意夺取他们的性命。却如恶魔般从此失去了梦与心。那片神秘的区域被叫做地狱门，而那些因此获取超能力的人被叫做契约者。美国的CIA，英国的MI6，日本的警视厅统统对神秘的地狱门进行了调查研究，甚至那个庞大的神秘组织潘多拉也开展行动，妄图消灭契约者们。知道真相的契约者们则团结在一起进行对抗。而另一方面，有着“黑之死神”之名的黑（木内秀信 配音）接受命令执行着组织的任务，同时也一直在寻找5年前失踪的妹妹。在执行任务的过程中黑偶遇之前的恋人琥珀（川上伦子 配音），发现眼前此人似乎隐藏着一些不为人知的秘密。

随着“地狱之门”的出现，美丽的星空被掩盖，取而代之的是用来监视“契约者”行动的虚假星空。“契约者”是接触了“地狱之门”里的物质后，获得超能力的人。作为被选中的人群，他们冷酷、无情，让人充满畏惧与疑惑。各种神秘组织为了自身利益，利用契约者的超能力展开混战。 　　本来不是契约者的黑，为了妹妹白，不得不违背自己的意志加入战斗，并与契约者琥珀相爱。可是他渐渐发现琥珀背叛了组织，也背叛了自己；在神秘事件后妹妹也失去踪迹。愤怒的黑终于成为真正的契约者，被人称为黑色死神，被诅咒的契约者。 　　在执行组织任务中黑再次遇到琥珀，而琥珀的言行愈加充满神秘，似乎背叛之下有着许多难言之隐。为了找到妹妹，黑追踪着琥珀，渐渐的看到混战背后更大的秘密。黑能否找到妹妹呢？他该为自己和契约者的命运做出怎样的抉择？

因为所在的波路中学倒闭，新学期一开始，先岛光（花江夏树 配音）和青梅竹马向井户爱花（花泽香菜 配音）以及好友比良平千咲（茅野爱衣 配音）、伊佐木要（逢坂良太 配音）转校至位于陆地的美滨中学继续学业。先岛和朋友们是生活在海底的海之民，传说很久以前人类全部始于大海，大有一部分人迷恋陆地的生活，而放弃了神赐予的“胞衣”。千百年来，陆之民和海之民在摩擦中共存，他们之间有矛盾，有误会，也有憧憬和向往。在新的学校，先岛和爱花结识了生活在海边的少年木原纺（石川界人 饰）。

威廉沃尔夫不是普通的人类男孩。在 Everything Factory 的神奇 spryte 王国中，他是 Wolfboy，与他的新 spryte 朋友们一起，他了解到他生动的想象力和无限的创造力具有改变世界的力量。

高中生四月一日君寻（福山润 配音），有着异于常人的体质，他可以看到并且吸引各种鬼怪。他身边的好友百目鬼（中井和哉 配音）和小葵（伊藤静 配音）都是特殊能力者，百目鬼有着驱除妖魔的能力，而小葵则有招来厄运的体质。在命运的牵引下，四月一日闯进了壹原侑子（大原沙耶香 配音）的店里，这是一家可以帮人实现任何愿望的店，但是委托人必须付出对等代价。于是四月一日委托侑子帮他远离鬼怪，作为代价，他留在店里打工。随后，他又结识了一个少女灵能力者，五月七日小羽。 　　因为长期留在店里打工，四月一日穿越在次元间，接触到各种不思议现象。而在这一季中，四月一日有了更多切身的经历，他更加清晰地看到了自己和身边人之间息息相关的命运。梦境与现实，前世与未来，原来一切都正如侑子所说的——这个世上没有什么偶然，有的只有必然…

西村英骑（丰永利行 配音）是一名热爱网络游戏的少年，在电子信息构筑的虚幻世界之中，他信奉着“防守就是最有利的攻击”这一信条。曾经，西村在网络世界中有着一段无疾而终的恋情，他喜欢上的女孩，其在现实中的身份竟然是中年欧吉桑。经此一役，大受刺激的西村发誓再也不在网络中相信任何人。 　　某日，网络中一位名叫亚子（日高里菜 配音）的玩家向西村告白，尽管西村接受了她的表白并且在游戏中举行了婚礼，但内心里始终对对方持有着怀疑的态度。之后，工会举行的线下聚会，让西村没有想到的是，不仅亚子是真真正正的女孩子，就连另外两名玩家濑川茜（水濑祈 配音）和御圣院杏（市道真央 配音）亦是如假包换的女孩子。

故事发生在未来的世界之中，彼时，人类已经可以在日常生活中使用少量的魔法月白瞳美（石原夏织 配音）是拥有着魔法使血统的魔族末裔，虽然能够使用魔法，但是在生活里月白一直都对此十分回避。月白自幼患有色觉障碍症，无法看到颜色，生活在黑白世界中的她因此性格也十分的压抑和冷漠。祖母非常担心月白的未来，于是施法将她送回了2018年的长崎。 　　在60年前的长崎，月白遇见了还是高中生的祖母琥珀（本渡枫 配音），更让月白感到惊讶的是，自己眼前的世界竟然变得绚丽多彩起来。热衷于画画的葵唯翔（千叶翔也 配音）、温文尔雅的山吹将（前田诚二 配音）、开朗乐观的川合胡桃（东山奈央 配音），在这里，月白很快就交到了朋友。